杨玉科恼羞异常，他没想到陈玉成会放弃守城，出师不利，第一回合就损失惨重。
杨玉科收拾好心情，继续进攻，他留下五千守军防守台湾城，然后帅主力进攻善化里。
陈玉成随即放弃善化里等地，直接北上与嘉义的英军会合，开始修筑壕垒，等待革命军进攻。
杨玉科占领整个台南后兵分两路，一路进攻嘉义，一路进攻彰化。陈玉成也做出相应部署，从基隆、淡水厅调集三万人支援彰化。
双方开始在这二城展开激战，大战一个月，终于占领嘉义，英法联军只有两千人突围，革命军损失六千人。
杨玉科随后兵合一处猛攻彰化城，正当彰化将要被攻破时，场外传来了声音：“台湾城被偷袭，形势危急！”
杨玉科大吃一惊，不信道：“哪里来的联军，竟然绕道自己的后面。”
但这些皆由各位教官判定，他只能接受这个事实。随即派嘉义守军支援台湾城，要知道那里可是全军的补给基地。
杨玉科此时默算各处兵力部署，冷哼道：“果然大手笔，竟然将基隆的守军调到台南，那我就不客气了！”
随后，杨玉科命令一万部队牵制彰化之敌，自己率领三万主力直扑基隆。